《淡水渔业》目前收稿方向有:生长性能、遗传多样性、环境因子、中华绒螯蟹(Eriocheir sinensis)、群落结构、浮游植物、罗非鱼、基因表达、大口黑鲈(Micropterus salmoides)、分离鉴定、生物量、氨基酸、克氏原螯虾(Procambarus clarkii)、初步研究、鱼类资源、长江上游、性腺发育、浮游植物群落结构、养殖水体、黄颡鱼(Pelteobagrus fulvidraco)、养殖群体、肝胰腺、草鱼(Ctenopharyngodon idellus)、比较研究、生化指标、DNA、肌肉营养成分、微卫星标记、营养成分、病原菌、黄鳝(Monopterus albus)、遗传结构、SOD、鲢(Hypophthalmichthys molitrix)、抗氧化、微卫星、体质量、肌肉品质、非特异性免疫、消化酶。